《稅收征管法》稅款的退還制度有以下幾點：一、納稅人超過應納稅額繳納的稅款，稅務機關發現后應當立即退還；二、納稅人自結算繳納稅款之日起3年內發現的，可以向稅務機關要求退還多繳的稅款并加算銀行同期存款利息，稅務機關及時查實后應當立即退還；三、涉及從國庫中退庫的，依照法律、行政法規有關國庫管理的規定退還。