問題內容：

    我們的一家下屬公司，在上海，最近收購了一家注冊在陜西西安的公司的股權。該公司原來有兩個個人持股。 由于該下屬公司擬支付的價款高于被收購公司的注冊資本，根據稅法，該下屬公司應代扣代價個人所得稅。 問題是，我們處于謹慎咨詢了西安和上海兩家稅務機關。西安稅務機關認為企業位西安且股東居住在西安，個人所得稅款應繳納在西安。上海稅務機關認為，個人所得稅應由支付人在其主管稅務機關支付。我們查閱了個人所得稅法，沒有發現明確的規定。請問 ，我們該如何處理？

回復意見：

    根據《國家稅務總局關于加強股權轉讓所得征收個人所得稅管理的通知》（國稅函[2009]285號）規定：
　　“三、個人股東股權轉讓所得個人所得稅以發生股權變更企業所在地地稅機關為主管稅務機關。納稅人或扣繳義務人應到主管稅務機關辦理納稅申報和稅款入庫手續。主管稅務機關應按照《個人所得稅法》和《稅收征收管理法》的規定，獲取個人股權轉讓信息，對股權轉讓涉稅事項進行管理、評估和檢查，并對其中涉及的稅收違法行為依法進行處罰。”
　　 
　　因此，個人股東股權轉讓所得個人所得稅以發生股權變更企業所在地地稅機關為主管稅務機關。納稅人或扣繳義務人應到主管稅務機關辦理納稅申報和稅款入庫手續。
　　 
　　 
　　上述回復僅供參考。有關具體辦理程序方面的事宜請直接向您的主管或所在地稅務機關咨詢。

                                                                                                            國家稅務總局 
                                                                                                            2009/07/16