最近，國務院辦公廳印發《關于促進社會辦醫加快發展若干政策措施的通知》（國辦發〔2015〕45號），要求落實醫療機構稅收政策，鼓勵和引導社會資本舉辦醫療機構。目前，我國公立醫療機構都是非營利性，非公立醫療機構即社會資本所辦醫療機構包括營利性和非營利性兩類，相應的稅收政策適用也應有所區分。

共性

●營業稅

營業稅暫行條例第八條第（三）款規定，醫院、診所和其他醫療機構提供的醫療服務免征營業稅。

提示：1.自2009年1月1日起，醫療機構（包括營利性、非營利性的公立、民營、個體以及部隊醫療機構）不再區分營利性和非營利性醫療機構，對其取得的醫療服務收入均免征營業稅，不受價格期限的限制。

2.對非營利性醫療機構從事非醫療服務取得的收入，如租賃收入、財產轉讓收入、培訓收入、對外投資收入等應按規定征收各項稅收。

●個人所得稅

《財政部、國家稅務總局關于醫療機構有關個人所得稅政策問題的通知》（財稅〔2003〕109號）規定，《財政部、國家稅務總局關于醫療衛生機構有關稅收政策的通知》（財稅〔2000〕42號）規定的對非營利的醫療機構按照國家規定的價格取得的醫療服務收入免征各項稅收，僅指機構自身的各項稅收，不包括個人從醫療機構取得所得應納的個人所得稅。按照個人所得稅法的規定，個人取得應稅所得，應依法繳納個人所得稅。個人因在醫療機構（包括營利性醫療機構和非營利性醫療機構）任職而取得的所得，依據個人所得稅法的規定，應按照“工資、薪金所得”應稅項目計征個人所得稅。

●稅務登記

無論營利性與非營利性醫療機構均應依法辦理稅務登記。國辦發〔2015〕45號文件規定，社會資本可按照經營目的，自主申辦營利性或非營利性醫療機構。衛生、民政、工商、稅務等相關部門要依法登記，分類管理。

稅收征管法實施細則第十二條規定，從事生產、經營的納稅人應當自領取營業執照之日起30日內，向生產、經營地或者納稅義務發生地的主管稅務機關申報辦理稅務登記，如實填寫稅務登記表，并按照稅務機關的要求提供有關證件、資料。前款規定以外的納稅人，除國家機關和個人外，應當自納稅義務發生之日起30日內，持有關證件向所在地的主管稅務機關申報辦理稅務登記。

發票管理辦法第十五條規定，需要領購發票的單位和個人，應當持稅務登記證件、經辦人身份證明、按照國務院稅務主管部門規定式樣制作的發票專用章的印模，向主管稅務機關辦理發票領購手續。

稅收征管法實施細則第十八條規定，除按照規定不需要發給稅務登記證件的外，納稅人辦理包括申請減稅、免稅、退稅和領購發票等事項時，必須持稅務登記證件。

稅務登記管理辦法第九條規定，納稅人辦理開立銀行賬戶和領購發票事項時，必須提供稅務登記證件，納稅人辦理其他稅務事項時，應當出示稅務登記證件，經稅務機關核準相關信息后辦理手續。

差異

●優惠規定

1.非營利性醫療機構

增值稅：對非營利性醫療機構自產自用的制劑，免征增值稅；非營利性醫療機構的藥房分離為獨立的藥品零售企業，應按規定征收各項稅收。

房產稅、土地使用稅、車船使用稅：對符合規定的社會辦非營利性醫療機構自用的房產、土地、車船，免征房產稅、城鎮土地使用稅和車船使用稅。

企業所得稅：社會辦醫療機構按照企業所得稅法規定，經認定為非營利組織的，對其提供的醫療服務等符合條件的收入免征企業所得稅；企業、個人通過公益性社會團體或者縣級以上人民政府及其部門對社會辦非營利性醫療機構的捐贈，按照稅法規定予以稅前扣除。